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目前降低养殖水体氨氮的方法有化学的氧化还原法、物理的吸附法或开泵增氧法、生物的肥水及细菌分解法等。前两种方法长期使用都会改变池塘底泥的性质，而且不能从根本上解决问题，而生物em菌降解水体氨氮、亚硝态氮是依靠调节水体中的生物因子(藻类及微生物)对水体的有机污染物进行有效转化，达到自净作用，有利于建立合理的水生生态循环，是一种健康养殖水质调控的有效方法。
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微藻对水体的净化作用机理及在养殖水体中除氨氦的研究
微藻也称单细胞藻类，是一种在显微镜下才能辨别其形态的微小的藻类类群，约占全球 已知3万余种藻类的70%。微藻是以水为电子供体的光能自养生物，以光能作为能源，利用氮、磷等营养物质合成复杂的有机质。被藻细胞吸收的铵盐可以用于和蛋白质、叶绿素等含氮物质的合成，而微藻又为多种鱼类提供食饵，因此，微藻的生长可降低水体中的氮、磷含量。对氮和磷吸收效果最好的微藻是螺旋藻、小球藻、栅藻、颤藻，栅列藻等，尤以小球藻的降氮能力最强。Lefebvre等人的试验结果表明硅藻可吸收养鱼池塘废水富含的无机物质 N、P、Si等，对废水净化率可达到90%。Duma报道鲍氏席藻对养殖废水氮去除可达80%。#咨—询%+V? haowangnong
在养殖水体中接种有益藻类，既可起到除氮增氧的作用，又起到增饵肥水作用 ，当其形成优势群体时，还能抑制有害藻类（微囊藻）生长。水产养殖中适合养鱼的最佳水色为油绿色(浮游植物主要种类为隐藻 、硅藻 、金黄藻和绿球藻等)和浅褐色(浮游植物主要种类为硅藻 、金黄藻、黄绿藻等)，而这两类水中所含的藻类均易被鱼类消化吸收利用，是鱼类等养殖品种非常好的天然饵料。藻类的光合作用还能产生大量的氧气，据报道，水体中的溶氧80%来自藻类的光合作用。氧充足能促进的转化，同时，可减少水体因缺氧而形成的恶臭气味，改善水体生态环境，抑制和减轻氨氮、硫化氢对鱼类的毒害作用，提高鱼类食欲和饲料利用率，促进鱼类生长发育。
微生态制剂在淡水养殖中的研究及应用现状
我们的水产EM菌就是微生态制剂，微生物制剂是从天然环境中筛选出来的微生物菌体经培养、繁殖后制成的含有大量有益菌的活性菌制剂，是近年来发展起来的新型鱼饵添加剂。养殖水体环境本身就是一个由多种微生物组成的动态平衡系统，有益菌和有害菌共存。众多研究表明，当向水体添加有益微生物，通过大量繁殖成为优势种群可抑制有害病菌的生长，同时通过有益微生物的新陈代谢，可降低水中过剩的营养物质和其他有害物质，对去除水体中的氨态氮、有机质、降低 BOD、COD和增加溶解氧等方面有明显的调节作用，同时也调节水体的pH值 ，促进底泥中氮磷的释放，以促进浮游生物的生长。
我国于20世纪80年代着手研究微生态制剂对水质的净化作用 ，近年来应用于水产养殖业已积累了不少宝贵经验。水产EM菌微生态态制剂最早是应用于水族箱养殖 ，用于海水养殖特别是对虾的集约化养殖已有较多报道，而用于淡水养殖的水质调控则是则是近年来才展开。 目前，可用于开发调控水体微生态制剂的微生物种群比较多，其中能降低水体氨氮的微生物主要有光合细菌、芽抱杆菌、硝化细菌等。